Опреснение влечет за собой огромные экологические издержки с точки зрения ископаемого топлива, используемого для осуществления процесса.
Страны Персидского залива являются одними из крупнейших потребителей пресной воды в мире и сильно зависят от опреснительных установок. Южное побережье Персидского залива усеяно более чем 300 опреснительными установками — в основном в Саудовской Аравии, ОАЭ, Кувейте и Бахрейне.
Большинство опреснительных установок работают на нефти и газе. Это либо технология термической обработки, при которой конденсируется пар из кипящей воды, либо технология обратного осмоса, которая в сильно зависит от электроэнергии, вырабатываемой с использованием природного газа.
Хотя организаторы чемпионата в Катаре утверждает, что он будет углеродно-нейтральным, климатические организации уже выражают сомнения. Бросаются в глаза дополнительные потребности в пресной воде. Для проведения турнира потребуется восемь стадионов и более 130 дополнительных тренировочных площадок. Процесс создания подходящего газона для футбола в катарском климате очень сложен. Он требует обдува травы охлажденным воздухом и ежедневного полива 10 000 литрами опресненной воды.
Также опреснение является одним из серьезных факторов загрязнения морской экосистемы Персидского залива. Так в результате технологических процессов образуется рассол, высокосоленая отработанная жидкость, обычно сбрасываемая в море в виде более соленой, токсичной и более теплой морской воды. Такой рассол может содержать хлор, тяжелые металлы и пеногасители, добавляемые в процессе опреснения. Все это может нанести вред коралловым рифам и более мелким морским организмам, обитающим на морском дне.