Каталог океанских генов KAUST Metagenome Analysis Platform (KMAP ) 1.0 — это первый шаг на пути к разработке атласа глобального генома океана, в котором будет документирован каждый ген всех морских видов по всему миру — от бактерий и грибов до растений и животных.
Этот каталог, посвященный морским микробам, играющим важную роль в жизни людей и воздействующим на здоровье океана и климат Земли, является результатом масштабного исследования, опубликованного в журнале Frontiers in Science.Используя передовую вычислительную инфраструктуру, исследователи просканировали последовательности ДНК из более чем 2100 образцов океанской воды, взятых на разных глубинах и в различных частях мира.
Этот подход позволил выделить 317,5 миллионов групп генов, более половины из которых можно классифицировать по типу организма и функции генов. Сопоставление этой информации с местоположением образца и типом среды обитания дало уникальную картину о том, какие микробы преобладают, где они обитают и какова их роль в экосистемах.
KMAP 1.0 уже привлек внимание научного сообщества, выявив различия в микробной активности в разных частях океана. Это включает в себя не только толщу воды, но и дно океана, а также выявило удивительное количество грибов в «сумеречной» мезопелагической зоне. Эти результаты помогут ученым понять, как микроорганизмы, населяющие различные среды, взаимодействуют, формируют экосистемы и оказывают влияние на океан и климат.KMAP 1.0 становится первым шагом в создании атласа глобального генома океана, который будет включать документацию каждого гена всех морских видов по всему миру, начиная от бактерий и грибов и заканчивая растениями и животными.
Однако ученые предупреждают, что будущее этого каталога остается неопределенным из-за препятствий в международном законодательстве о распределении выгод от исследований, проведенных в международных водах. Поэтому важно преодолеть эти трудности, уделяя внимание малоизученным областям океана, чтобы обеспечить постоянное обновление каталога и продолжать расширять наше понимание океанической биологии и климатических изменениях.
